孝南區地理位置十分優越,地處東經113°50'—114°11'、北緯30°47'—31°9'之間,位于長江以北,大別山、桐柏山山脈以南,江漢平原東北部,湖北省中北部偏東,東鄰武漢市黃陂區,南連漢川市和武漢市東西湖區,西靠云夢縣,北接孝昌縣。城區北距北京市鐵路里程1152公里,南距省會武漢市鐵路里程70公里、公路里程62公里,距武漢天河國際機場僅45公里。
孝南區地形東北高,西南低,以平原湖區為主,境內河流密布。地貌主要分平原、丘崗兩種類型。
平原湖區:分布在陡崗鎮、肖港鎮、朋興鄉、新鋪鎮、三汊鎮、祝站鎮、閔集鄉、毛陳鎮、臥龍鄉、朱湖農場、東山頭原種場、書院街道、新華街道、廣場街道、車站街道一帶,平原面積696平方公里,占全區面積的67.3%,海拔高度20—
丘陵崗地:主要分布在楊店鎮、西河鎮一帶,海拔高度50—