鴛鴦湖新石器文化遺址，是1984年被發現考證后確認為一處文化遺跡。同樣是一處人類文明的發祥地，它與水洞溝古人類文化遺址和三道溝新石器文化遺址，應該有某種程度的聯系。從我們探尋靈武的歷史蹤跡來看，毫無疑問，首先可以肯定的是，靈武是一個歷史悠久的文化富地，點點遺跡猶如珍珠散布市域，自北而南，由西向東，隨處可見。
鴛鴦湖新石器文化遺跡位于市區東部寧東鎮境內毛烏素沙漠腹地，曾被人譽為沙漠明珠。這是一個由兩個湖泊組成的妙地，因而被稱為鴛鴦湖。沙漠中，難得有水，有水就有生命，妙得是這里曾是一片水域，水域方圓散落著遠古人類留給我們的信息，這些信息究竟記載了怎樣的故事？
1960年，我國著名歷史地理學家候仁之先生一行數人在考察鄂爾多斯高原南部沙區時進入磁窯 堡一帶，目的是尋訪聞名已久的鴛鴦湖。他在《光明日報.鴛鴦湖》一文中說：“鴛鴦湖——多么美麗的名字啊！在一帶沙區中竟然有這樣一個名稱美麗的湖泊出現，又是多么令人向往的事。”不過《靈州志跡》中記載的鴛鴦湖（韋州）與靈武鴛鴦湖是兩個地方。中科院治沙隊五十年代在一項報告中說：“鴛鴦湖地面有積水……，湖周圍皆被流沙所包圍。”但候仁之先生經實地考察后說：“鴛鴦湖還不能說是完全處在流沙包圍中，因為湖的西面雖然是沙丘起伏，直逼湖岸，但是東邊積沙卻不很多。在湖東岸平緩的斜坡上，大約有百米之遙，是一片荒落了的墓地。墓的前面有一座道光七年（1827年）立的石坊，石坊橫額正面題的是“劉氏祖阡”，背面是“木本水源”。劉氏何許人，姑且不談，但僅此足可說明，在道光年間以前，這個湖泊即已存在。民間傳說，光緒年間湖水還很大，湖中水鳥也很多，草木旺盛，湖水直流西天河。”
鴛鴦湖分南北兩個湖， 一為咸水湖，一為泉水所形成的淡水湖。沙漠化以后的湖泊變小了，水草豐茂的地方也沒有了。
八十年代后，受季風影響，湖的西岸和北岸沙丘逐步移動，竟裸露出新石器文化遺址。地表上散布著很多石器和陶器殘片以及人類活動的灰坑和灰燼。已發現的遺址共有三處。一號遺址在鴛鴦湖西岸，地表散布著磨制的石器和陶器殘片，其中以雙面磨制刀為精。陶片有紅陶和灰陶。器形以盆罐為主，素面為多。二號遺址在湖南岸100米處高埠上，范圍約一公里。主要有磨制的石斧殘件和陶器殘片與灰燼。三號遺址在鴛鴦湖東北二公里處，范圍約一公里。主要有磨制的石斧、素面紅陶、夾沙細紋灰陶、波浪紋灰陶片等。今日的鴛鴦湖依然能追尋古人類給悠悠漫長的歷史留下的一點痕跡，而且鴛鴦湖以美的名字和動人的傳說吸引著眾多游客的向往。
