序號 保護區名稱 區域 面積 主要保護對象
新01 卡拉麥里山 阜康市、吉木薩爾縣、奇臺縣、福海縣、富蘊縣、青河縣 1423558 野驢等有蹄類野生動物及其生境
新02 天池 阜康市 38069 森林生態系統、高山湖泊
新03 奇臺荒漠類草地 奇臺縣 38600 荒漠生態系統及荒漠草原生態系統
新04 夏爾希里 博樂市 31400 森林及野生動物資源
新05 艾比湖濕地 精河縣 267085 濕地及珍稀野生動植物
新06 溫泉北鯢 溫泉縣 695 新疆北鯢及其生境
新07 羅布泊野駱駝 巴音郭楞蒙古自治州、吐魯番地區和哈密地區 7800000 野駱駝及其生境
新08 塔里木胡楊 尉犁縣、輪臺縣 395420 胡楊、灰楊林
新09 阿爾金山 若羌縣 4500000 有蹄類野生動物及高原生態系統
新10 中昆侖 且末縣 3200000 藏羚羊等野生動物
新11 巴音布魯克 和靜縣 100000 天鵝等珍稀水禽、沼澤濕地
新12 托木爾峰 溫宿縣 237600 森林及野生動植物
新13 帕米爾高原濕地 阿克陶縣 125600 典型高原濕地生態系統
新14 塔什庫爾干野生動物 塔什庫爾干塔吉克自治縣 1500000 雪豹、盤羊等高山野生動物
新15 伊犁小葉白蠟 伊寧縣 405 小葉白蠟樹及其生境
新16 霍城四爪陸龜 霍城縣 27000 四爪陸龜及其生境
新17 鞏留野核桃 鞏留縣 1180 野核桃及其生境
新18 西天山 鞏留縣 31217 雪嶺云杉林
新19 新源山地草甸類草地 新源縣 65300 草原草甸、野生牧草近緣種
新20 甘家湖梭梭林 烏蘇市、精河縣 54667 梭梭林及其生境
新21 塔城巴爾魯克山 裕民縣 115000 野巴旦杏及其生境
新22 額爾齊斯河科克托海濕地 阿勒泰地區 99040 河流濕地、湖泊濕地、沼澤濕地動植物資源
新23 克科蘇濕地 阿勒泰地區 30667 濕地及動植物資源
新24 兩河源頭 阿勒泰地區 1130000 森林、動植物、濕地
新25 哈納斯 布爾津縣、哈巴河縣 220162 森林生態系統及自然景觀
新26 金塔斯山地草原 福海縣 56700 山地草原生態系統
新27 布爾根河貍 青河縣 5000 河貍及其生境
